Si se deja llevar por la forma de las palabras, la moral vendría de morar, sería lo relativo a residir en una casa, lo que se hace en comunidad, por lo que depende de las relaciones sociales, del vínculo entre los individuos. En inglés, "moron", que es como "morante", quiere decir "idiota", como si quedarse en la casa fuese cosa de infradotados. La raíz viene del griego ático "moron" y del sánscrito "murah", según el Online Etimology Dictionary, el cual no vincula a esa definición con la de habitar.
La etimología de "costumbre" la liga a lo cercano, como el espacio de vida.
Puede que al término le pase lo mismo que al de la ingenuidad, que su denotación remite a la génesis, el engendramiento, local, y su connotación a lo inferior, tal como lo pensaron los conquistadores, que tomaron a los moradores invadidos por estúpidos.